與“海洋生態系統”相對應。在淡水中由生物群落及其環境相互作用所構成的自然系統。分為靜水的和流動水的兩種類型。前者指淡水湖泊、沼澤、池塘和水庫等；后者指河流、溪流和水渠等。具有易被破壞、難以恢復的特征。